胆囊术后的种种不良反应也引起了医学专家的重视，国内外研究发现，胆囊切除术后对人体可能有以下一些不良影响。
1、胆囊切除与食管黏膜损伤。
胆囊切除后引发胆汁反流，反流的胆汁长时间作用于食管黏膜可以造成严重的食管炎等。
2、胆囊切除与胃黏膜损伤。
胆囊切除后，很多患者胃窦－幽门－十二指肠运动失调，会引发十二指肠液反流入胃。反流的胆汁会导致胃黏膜充血水肿、糜烂溃疡形成，黏膜脆性增加、黏膜腺体增生或萎缩。息肉形成或萎缩性胃炎发生。
3、胆囊切除切除与消化不良、腹胀、腹泻、打嗝。
胆囊被切除后，胆囊对肝脏所分泌的胆汁进行贮藏、浓缩、排泄的功能丧失。当我们进食美味佳肴，需大量胆汁帮助消化时，此时体内却无胆囊存储的“富余胆汁”倾力相助，从而影响食物中脂肪的消化吸收，造成身体消化不良、脂溶性维生素缺乏、腹胀、腹泻、打嗝等。
4、胆囊切除后与反流性胃炎、食管炎。
胆囊切除后，肝脏分泌的胆汁只好持续不断地进入肠道，造成胆汁在十二指肠内淤积，进而逆流入胃，使胃内PH值升高，细菌繁殖，导致胃粘膜充血、水肿、脆性的增加，胃腺体萎缩以及溃疡的形成，引发胃炎，再上则引发食管炎。
5、胆囊切除与胆管结石。
临床研究发现，胆囊切除后，肝胆管失去胆囊高浓缩胆汁对胆固醇的溶解，久而久之，容易造成胆固醇的积累，在胆总管内形成结石。
6、胆囊切除与结肠癌。
胆囊切除术后，导致肝胆管分泌出的初级胆酸24小时持续不断的流入肠道，并与细菌接触，产生大量次级胆酸，而次级胆酸能使结肠粘膜细胞有丝分裂增强，容易引起结肠癌变。
7.其他。
如导致括约肌功能障碍，免疫系统、内分泌系统不良，术后心理障碍等。
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